跨学科硕士论文维普查重的方法包括：1.利用查重软件进行查重比对，如Turnitin、维普查重系统等；2.检查论文格式和引用格式是否符合要求；3.避免抄袭，注重原创性；4.定期检查论文的查重报告，及时调整论文内容。

此外，跨学科硕士论文维普查重还可以通过合理引用文献、注重论文结构完整性、注重数据真实性等方式来提高论文的质量和通过率。学生在写作过程中应该注意以上方法，确保论文顺利通过维普查重，取得学位。